ДНК тесты и генеалогия

Модератор: MOCKBA

Ответить
Сообщение
Автор
Аватара пользователя
avramenko
Сообщения: 195
Зарегистрирован: 10.08.2009
Откуда: Литва, Голландия
Поблагодарили: 16 раз
Контактная информация:

ДНК тесты и генеалогия

#901 avramenko » 30 сен 2009, 00:14

MOCKBA: Тема переживает взрывное развитие - половина новых страниц всего за один год из почти десятилетней истории темы. Тут и технические советы и вопросы, и рассказы об удачах или удивительных открытиях, и обсуждение распродаж ... Поскольку ориентироваться в такой многостраничной ветке стало трудно, я собрал самые важные ссылки в первое сообщение и прикрепил его.

Общая информация о хромосомах, наследовании, и переменчивости ДНК (2009)
Про три типа тестов: аутосомный, Y-хромосомы и ДНК митохондрий (мтДНК) (2010); Подробнее про те же три типа анализов, со ссылками (2012)

Полезные ссылки: какая часть генома наследуется при разных степенях фактического родства (в среднем, а не у ашкеназов)
http://www.isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_statistics ; http://dna-explained.com/2013/09/29/why ... my-cousin/
и насколько больше совпадений бывает между ашкеназами

Как меняется с дальностью родства длина совпадающих сегментов (2017)
Как работает "раскраска хромосом" по этническому происхождению ДНК (2017), ( + 2020), почему народы России оказываются за пределами списков этнических ДНК в результатах анализов (2017) и как усовершенствования техники анализа все-таки позволяют "поставить страны Восточной Европы" на карту этнического состава хромосом (2018)

+ Исследования исторической генетики евреев (тема эта развивается быстро с развитием технологий и с ростом охвата населения генетической генеалогией, так что самые старые источники могут оказаться менее точными)
"Впервые сопоставив полные геномы евреев из общин разных стран, ученые установили единство их происхождения, точные сроки, когда эти группы разошлись, и географию их древних миграций." (2014)
Из какого генетического теста сделаны собственно ашкеназы (2018) (+2019) (+2020 )
Насколько схожи другие еврейские народы с ашкеназами и друг с другом (2020)
и более узко-технически: что происходит в ДНК, если праотцы-мигранты берут праматерей из местных (2017)

Аватара пользователя
MOCKBA
Сообщения: 5974
Зарегистрирован: 23.01.2016
Откуда: Америка
Благодарил (а): 2026 раз
Поблагодарили: 2336 раз

ДНК тесты и генеалогия

#902 MOCKBA » 23 мар 2019, 18:51

Alexey_VB писал(а):
23 мар 2019, 18:32
1. изначально сделав аутосомный тест в 23andMe затем не надо отправлять новые образцы биоматериала в 23andMe?
2. общий файл 23andMe означает ли универсальный сырой файл? т.е. сырой (аутосомный=общий=универсальный) файл 23andMe можно ли использовать для загрузки на сайты других компаний для заказа/выполнения тестов Y-DNA или mtDNA этими компаниями?
3. или, в таком случае, отличия в сырых файлах компаний приведут к дополнительным ошибкам в результатах новых тестов?
1 - да
по 2 и 3 у меня ответа нет, я не увлекаюсь анализами маркеров, переходящих от только одного родителя. Но, думаю, найти инфу по правилам загрузки на фтДНК нетрудно. Общие соображения таковы: фтДНК продает анализы разных цен с разным числом маркеров, а 23эндМи - однотипный анализ со сравнительно небольшим числом игрек-хромосомных маркеров, который интересен для вопроса о "древних корнях", но для поиска сравнительно недавних предков, для которого вся сермяга в редких маркерах, малопригоден.

По причине недостаточного числа маркеров для поиска дальних родственников у ашкеназов малопригодны и стандартные аутосомные тесты, и логика процесса тут такая же - чтобы видеть общность или отстутствие общности схожих сегментов ДНК в исторически недавний период, нужно больше маркеров ... но это уже отдельная песня.
Гоникберг (Могилев-Подольский, Ушицкий уезд, и повсюду), Прусс, Черницкий(Городок Витебской), Пальман (Витебск), Богин, Рудерман (Минск), Лапицкий (Копысь, Киев)

Alexey_VB
Сообщения: 362
Зарегистрирован: 07.10.2016
Благодарил (а): 133 раза
Поблагодарили: 129 раз

ДНК тесты и генеалогия

#903 Alexey_VB » 23 мар 2019, 20:10

MOCKBA, встречал на форуме forum.molgen.org упоминание, что 23andMe делает самый точный аутосомный тест (на этническое происхождение) именно для евреев.

Аватара пользователя
MOCKBA
Сообщения: 5974
Зарегистрирован: 23.01.2016
Откуда: Америка
Благодарил (а): 2026 раз
Поблагодарили: 2336 раз

ДНК тесты и генеалогия

#904 MOCKBA » 23 мар 2019, 20:36

Alexey_VB писал(а):
23 мар 2019, 20:10
точный аутосомный тест (на этническое происхождение) именно для евреев
Пришлось подправить свое сообщение - я имел в виду слабую пригодность современных аутосомных анализов для поиска дальних родственников.

Глубинные этнические корни по отцовской и материнской линии видит и 23andMe, для этого тоже не надо слишком много маркеров ... а вот различить по ДНК, если у вас с кем-то родство по ашкеназской линии "всего лишь 200 лет назад" или "тысячу лет назад", при теперешней плотности аутосомных маркеров нельзя (и при том числе Y/mtDNA маркеров, которые входят в анализ 23andMe, тоже нельзя)
Гоникберг (Могилев-Подольский, Ушицкий уезд, и повсюду), Прусс, Черницкий(Городок Витебской), Пальман (Витебск), Богин, Рудерман (Минск), Лапицкий (Копысь, Киев)

Аватара пользователя
vitalyka
Сообщения: 207
Зарегистрирован: 14.01.2013
Откуда: Самому интересно.
Благодарил (а): 108 раз
Поблагодарили: 76 раз

ДНК тесты и генеалогия

#905 vitalyka » 23 мар 2019, 20:36

Alexey_VB писал(а):
23 мар 2019, 18:32
MOCKBA, я правильно уловил, что тест в 23andMe имеет преимущество перед другими:
1. изначально сделав аутосомный тест в 23andMe, затем не надо отправлять новые образцы биоматериала в 23andMe?
2. общий файл 23andMe означает ли универсальный сырой файл? т.е. сырой (аутосомный=общий=универсальный) файл 23andMe можно ли использовать для загрузки на сайты других компаний для заказа/выполнения тестов Y-DNA или mtDNA этими компаниями?
3. или, в таком случае, отличия в сырых файлах компаний приведут к дополнительным ошибкам в результатах новых тестов?
1. 23иЯ предлагает всего один продукт (аутосомный тест), так что, если ваш образец добрался до лаборатории, и тест уже сделан, нет смысла в повтороной отправке образца того же человека.
2. Файл с результатами можно будет загрузить на любой сайт, где принимают результаты аутосомных тестов (МойХеритаж, ФТДНА, Жидматч, и т.п.).
Для других тестов (мт/СТР/СНП) нужно будет сдать анализ в соответствующую лабораторию. Сдав в ФТДНА, можно покрыть всю линейку их продуктов одним образцом.
3. Разница в "участках покрытия" аутосомных тестов 23иЯ и ФТДНА, например, есть, но весьма незначительная. Возможно, для чистого ашкенази вместо 17234-х "спекулятивных" совпаденцев тест покажет 17230. В любом случае, родного брата от вас не утаят, а троюродных сестёр будет столько, сколько ни одна разумная рождаемость не объяснит.

Alexey_VB
Сообщения: 362
Зарегистрирован: 07.10.2016
Благодарил (а): 133 раза
Поблагодарили: 129 раз

ДНК тесты и генеалогия

#906 Alexey_VB » 23 мар 2019, 21:20

Получив в прошлом году результаты аутосомных тестов Myheritage и загрузив сырые файлы на все возможные сайты (в том числе FTDNA), выше разбирался: надо ли отправлять новый образец "биоматериала". Ответ выше - "надо". Myheritage меня подвел, т.к. раньше предлагал варианты разных Y-ДНК и mtДНК тестов, но совсем недавно они исчезли из предложения ДНК тестов на их сайте и Сервисная поддержка подтвердила, что теперь Myheritage предлагает только один - "Family Finder" (аутосомный) тест. Хотя, при попытке заказа ДНК тестов на сайте Geni.com, ссылка выводит на страницу на сайте Myheritage со списком Y-ДНК и mtДНК тестов, которая не доступна напрямую с сайта Myheritage. Слышал упоминание на форуме molgen.org что Myheritage сам не делает тесты, а отправлял и отправляет биоматериалы в FTDNA. На их сайте "разблокировал" за $19 загруженный с Myheritage файл и получил вариант интерпретации этнического происхождения для жены. Поэтому я так и допытывался: надо/не надо отправлять новые "биоматериалы" в FTDNA. Пожалуй, надо мне ещё поддержке FTDNA задать вопрос: есть ли у них биоматериалы от Myheritage. Ведь FTDNA предлагает (по номеру моего эккаунта в их системе) выполнить разные Y-ДНК и mtДНК тесты, хотя последнее движение для оплаты я не сделал (жду скидки 25 апреля;) и не могу уверенно сказать: будут ли они отправлять мне свои киты для биоматериалов или нет.
Теперь остаётся понять: какие именно тесты надо сделать мне, матушке и жене и чтоб совсем не разориться.
Зыман (Сувалки, Гродно), Бородкин (Белая Церковь, Харьков), Мельницкий (Сувалки, Гродно), Гуревич (Мстиславль, Гадяч), Гофман (Ромны, Гадяч)

Никита 23
Сообщения: 29
Зарегистрирован: 14.12.2017
Откуда: Украина
Благодарил (а): 9 раз

ДНК тесты и генеалогия

#907 Никита 23 » 24 мар 2019, 16:23

Alexey_VB, Добрый день! Но кстати на большом форуме myjewishgen.org висит баннер MyFTDNA. Я выбирал между ним и MyHeritage и увидев этот баннер все таки как то больше склонился к тому который рекламировался на еврейском форуме)
Хотя может 23andMe лучше двух предыдущих. Тут не могу сказать.

nick_dovg
Сообщения: 529
Зарегистрирован: 15.01.2017
Благодарил (а): 402 раза
Поблагодарили: 750 раз

ДНК тесты и генеалогия

#908 nick_dovg » 25 мар 2019, 18:24

купоны на ФТДНА до конца месяца
$50 of Y37 code GGC19Y37 $70 off Y67 code GGC19Y67 $70 off Y111 code GGC19Y111 $200 off Big Y-700 code GGC19BIGY $50 off Mtfull sequence GGC19MTFULL

Аватара пользователя
Simona
Сообщения: 2244
Зарегистрирован: 19.02.2011
Откуда: Литва-Израиль
Благодарил (а): 473 раза
Поблагодарили: 438 раз

ДНК тесты и генеалогия

#909 Simona » 26 мар 2019, 00:37

Simona писал(а):
11 фев 2019, 01:15
MOCKBA писал(а):
С начала 2019 года импутация данных для (ранее несовместимых) чипов 23andMe v5 (для анализов, сделанных на 23эндМи после августа 2017) вошла в строй и на GedMatch.
https://genesis.gedmatch.com
Пароль и логин остаются те же, что и на старом GedMatch. Все старые данные загружены в новую базу. Так что результаты анализов для всех компаний снова можно сравнивать на бесплатном сайте (MyHeritage больше не предлагает бесплатную загрузку данных других лабораторий).
я давно на обоих, но что-то там у них не так пошло с подсчетом сМ, а после переноса данных вообще бардак, теперь у меня по две пары каждого вида, но что совершенно угнетает, сМ совсем разные:

к примеру, для члена семьи Х1
Largest Seg Total cM Gen Overlap Date Compared Testing Company
ОТЕЦ 281.5 3582.1 1.0 N/A 2018-07-25 Migration - F2 - T
МАТЬ 263.7 3579.6 1.0 N/A 2018-04-19 Migration - F2 - T
САМ Х1! 151.9 3576.2 1.0 424487 2018-12-10 FTDNA
ОТЕЦ 151.9 3571.2 1.0 321705 2018-12-10 FTDNA
МАТЬ 151.9 3570.9 1.0 324357 2018-12-10 FTDNA
ДЕД 172.5 1839.1 1.5 N/A 2018-10-27 Migration - F2 - T

Уточню, что дед загружен на дженезис не был изначально, потому только один раз
Обнаружила, что они все починили, и теперь похожие показатели:

Largest Seg Total cM Gen Overlap Date Compared Testing Company
САМ 151.9 3576.2 1.0 424487 2018-12-10 Migration - F2 - T
ОТЕЦ 151.9 3571.2 1.0 321705 2018-12-14 Migration - F2 - T
ОТЕЦ 151.9 3571.2 1.0 326397 2018-11-07 FTDNA
МАТЬ 151.9 3570.9 1.0 324358 2018-12-10 Migration - F2 - T
МАТЬ 151.9 3549.7 1.0 329036 2018-09-02 FTDNA
ДЕД 128.7 1832.7 1.5 315052 2018-12-17 Migration - F2 - T
ДЕД 128.7 1820.5 1.5 319610 2018-10-28 FTDNA

Но, конечно, непонятно с наидлинным сегментом, ополовинили.

Alexey_VB
Сообщения: 362
Зарегистрирован: 07.10.2016
Благодарил (а): 133 раза
Поблагодарили: 129 раз

ДНК тесты и генеалогия

#910 Alexey_VB » 27 мар 2019, 13:07

10 дней назад образцы ДНК двух родственников были доставлены в MyHeritage и неделю находятся в статусе "Идет процесс извлечения ДНК". Сегодня заглянул, чтобы проверить статус и обнаружил предупреждение: "В данный момент существуют задержки с обработкой результатов, поскольку мы осуществляем переход на новый, более усовершенствованный чип для анализа ДНК. Вы можете ожидать результаты между 15 апр. 2019 – 29 апр. 2019. Мы приносим извинения за неудобства."
Интересно, как новый чип повлияет на результаты/интерпретацию предыдущих тестов.
Зыман (Сувалки, Гродно), Бородкин (Белая Церковь, Харьков), Мельницкий (Сувалки, Гродно), Гуревич (Мстиславль, Гадяч), Гофман (Ромны, Гадяч)

Аватара пользователя
MOCKBA
Сообщения: 5974
Зарегистрирован: 23.01.2016
Откуда: Америка
Благодарил (а): 2026 раз
Поблагодарили: 2336 раз

ДНК тесты и генеалогия

#911 MOCKBA » 28 мар 2019, 02:10

Хотя я Y-хромосомными делами никогда не увлекался, но вместе с геномными данными от Данте получил результаты по 2691 СНИПу на Y-хромосоме. Вспомнил про сервис Ymatch, но оказалось, что они сдохли. И что, ничего взамен нету, где бы можно было сравнить гаплотипы по такому числу СНИПов?
Гоникберг (Могилев-Подольский, Ушицкий уезд, и повсюду), Прусс, Черницкий(Городок Витебской), Пальман (Витебск), Богин, Рудерман (Минск), Лапицкий (Копысь, Киев)

Аватара пользователя
vitalyka
Сообщения: 207
Зарегистрирован: 14.01.2013
Откуда: Самому интересно.
Благодарил (а): 108 раз
Поблагодарили: 76 раз

ДНК тесты и генеалогия

#912 vitalyka » 29 мар 2019, 19:50

MOCKBA, а в каком виде/формате снипы? А то я со стариком Данте лично не знаком.
Если это "положительные" снипы, т.е. позиции с предковыми значениями, то это очень приличный тест. От них и .BAM файл можно надеяться получить.
С ним сюда https://www.yfull.com

Только вы упомянули ДантеЛабз, как мне попался на глаза следующий пост: http://forum.molgen.org/index.php/topic ... #msg449065
Т.е. Данте поставляет, а УФул принимает результаты их тестирования в формате ВАМ файла. Только вот размер файла (~100ГБ) указан совершенно убийственный для целей передачи. Вероятно, там объединены все 23 пары хромосом. Желательно как-то выделить Y, но как??? Мои познания этого формата исчерпываются его названием "ВАМ".

Аватара пользователя
MOCKBA
Сообщения: 5974
Зарегистрирован: 23.01.2016
Откуда: Америка
Благодарил (а): 2026 раз
Поблагодарили: 2336 раз

ДНК тесты и генеалогия

#913 MOCKBA » 29 мар 2019, 21:56

vitalyka писал(а):
29 мар 2019, 19:50
ероятно, там объединены все 23 пары хромосом. Желательно как-то выделить Y, но как???
Да, это все хромосомы при 30-кратном покрытии. ~150 Gb. Вытащить игрек отдельно, конечно же, можно.
На молген этот, однако, хрен зайдешь, там, видимо, надо лучше знать русский язык, чем я владею. Откуда мне знать, что теперь на родной мове называется лакомка ))))
Гоникберг (Могилев-Подольский, Ушицкий уезд, и повсюду), Прусс, Черницкий(Городок Витебской), Пальман (Витебск), Богин, Рудерман (Минск), Лапицкий (Копысь, Киев)

Аватара пользователя
MOCKBA
Сообщения: 5974
Зарегистрирован: 23.01.2016
Откуда: Америка
Благодарил (а): 2026 раз
Поблагодарили: 2336 раз

ДНК тесты и генеалогия

#914 MOCKBA » 30 мар 2019, 01:51

vitalyka писал(а):
29 мар 2019, 19:50
Если это "положительные" снипы, т.е. позиции с предковыми значениями
Конечно снипы как снипы, с предковым и измененным значением. BAM еще долго будет ехать, а вот VCF у меня уже есть, и я быстренько прогнал его через сравнение с данными проекта 1000 геномов (где на самом деле 2503 генома). С более масштабным набором анализов в проекте gnomAD не сравнивал пока, у меня под рукой не нашлось их данных по Y-хромосоме.

Получается, что в моем наборе 174 "распространенных" снипа (с частотами от 20% то 50% у Европейцев), 198 "редких" (с процентной частотой), 4 "очень редких" (с частотой в десятые доли процента у европейцев), 12 снипов наблюдались в проекте, но не у европейцев, и 2303 "уникальных" снипа (не в том, конечно, смысле, что их вообще никто никогда не видел - этого я не проверял - а в том, что среди этих 2503 геномов таких снипов не встречалось).

Из 12 СНИПов, которые наблюдались не у европейцев - один был виден только у 5 латиноамериканцев из Медельина в Колумбии ... сефардское что-нибудь? Называется он rs769498822 и вообще не гуглится. Те же мужчины имели и rs751978621.
rs375374420 тоже был у колумбийцев и пуэрториканцев, но также еще и по всей Индии
8 СНИПов rs376089359, rs376200259, rs370714127, rs368402155, rs368118533, rs372702474, rs375919464, rs371365701 у нескольких колумбийцев и пуэрториканцев, и в Кении у трех мужчин из племени лухья (у меня как раз коллега по работе из лухья, из родов Мараголи и Тирики, сейчас побегу что ли хвастаться ... она рассказывала, что у них распространены слухи, что кому-то в предки затесались сомалийцы, а сомалийцы как раз чуток евреям родня по "дальним предкам с Ближнего Востока")
rs781520596 попалась в Африке и в Японии разок.

Ну в общем нормальная еврейская игрек-хромосома. Евреев у меня только в данных нет, чтобы сравнить.
Гоникберг (Могилев-Подольский, Ушицкий уезд, и повсюду), Прусс, Черницкий(Городок Витебской), Пальман (Витебск), Богин, Рудерман (Минск), Лапицкий (Копысь, Киев)

Аватара пользователя
vitalyka
Сообщения: 207
Зарегистрирован: 14.01.2013
Откуда: Самому интересно.
Благодарил (а): 108 раз
Поблагодарили: 76 раз

ДНК тесты и генеалогия

#915 vitalyka » 30 мар 2019, 03:19

MOCKBA, вы как-то нестандартно подходите к анализу снипов :-)
Снипы не стры, тут каждый имеет свой возраст. Важна временная последовательность их приобретения.
Из всех ваших 2000+ снипов важны всего несколько: в первую очередь один "терминальный" (самый свежий из тех, который есть у других протестированных), который определяет ваше положение на дереве человечества, а кроме него, возможно, несколько приватных, которые есть только у вас. Это ваш вклад в "науку", и подспорье в оценке возраста терминального снипа.
Все остальные имеет возраст тысячи и тысячи лет, т.е. за родство с главарём Медельинского картеля вас точно не привлекут, "за давностью родства" так сказать. Хотя вы действительно родственники, как впрочем и любые два мужчины на планете.
Последний раз редактировалось vitalyka 30 мар 2019, 03:25, всего редактировалось 3 раза.

Аватара пользователя
MOCKBA
Сообщения: 5974
Зарегистрирован: 23.01.2016
Откуда: Америка
Благодарил (а): 2026 раз
Поблагодарили: 2336 раз

ДНК тесты и генеалогия

#916 MOCKBA » 30 мар 2019, 04:18

vitalyka писал(а):
30 мар 2019, 03:19
который определяет ваше положение на дереве человечеств
vitalyka писал(а):
30 мар 2019, 03:19
ваше положение на дереве человечества
Ну я же не вижу, где древо всего рода человеческого :) и с трудом врубаюсь в зубодробительную номенклатуру снипов, принятую в мире любителей игрека. И, с другой стороны, понимал, что очень редкие снипы более интересны в плане древа всего этого рода, поскольку они более вероятно располагаются ближе к концу ветвей, а значит, не сто тысяч лет им в обед.

Вот добрался наконец до менее зубодробительного списка маркеров ISOGG https://docs.google.com/spreadsheets/d/ ... 1934392066
а с ним могу более-менее прорисовать ветвь ентого древа, которая, как я вижу, соответствует E1b1b1b2a1b, а это гаплогруппа характеризуется сразу 18-ю опредлевшимися у меня маркерами (описано тут https://docs.google.com/spreadsheets/d/ ... =149564181)
PF2029 E1b1b1b2a1b~
PF2032 E1b1b1b2a1b~
PF2033 E1b1b1b2a1b~
Y21036 E1b1b1b2a1b~
Y21037 E1b1b1b2a1b~
PF2044 E1b1b1b2a1b~
PF1977 E1b1b1b2a1b~
Y20229 E1b1b1b2a1b~
Y20226 E1b1b1b2a1b~
PF6767 E1b1b1b2a1b~
PF2063 E1b1b1b2a1b~
Z21472 E1b1b1b2a1b~
YP5411 E1b1b1b2a1b~
Z21474 E1b1b1b2a1b~
Y21025 E1b1b1b2a1b~
PF2077 E1b1b1b2a1b~
PF1996 E1b1b1b2a1b~
Y20228 E1b1b1b2a1b~

а те маркеры, которые я в предыдущем сообщении видел в "Тысяче геномов", действительно немножко поближе к корню древа, но не настолько уж близко:
группа снипов, общих с лухья - определяет E1b1b1b2,
rs769498822 и rs751978621 определяет E1b1b1b2a
а rs781520596 это собственно и есть Y20229, маркер, определяющий собственно E1b1b1b2a1b~

Но как двигаться дальше к концу веточки? Разветвления E1b1b1b2a1b~ на сайте yfull https://www.yfull.com/tree/E-PF2025/ характеризуются еще множеством названий маркеров, но в сводной таблице ISOGG их уже нет, и как определить, какой из маркеров имеет какое положение на Build 37 и какие аллели, я пока не пойму.
Гоникберг (Могилев-Подольский, Ушицкий уезд, и повсюду), Прусс, Черницкий(Городок Витебской), Пальман (Витебск), Богин, Рудерман (Минск), Лапицкий (Копысь, Киев)

Аватара пользователя
Elena G.
Сообщения: 1881
Зарегистрирован: 04.11.2010
Откуда: Canberra, Australia
Благодарил (а): 591 раз
Поблагодарили: 525 раз
Контактная информация:

ДНК тесты и генеалогия

#917 Elena G. » 30 мар 2019, 05:24

Коллеги, помогите, пожалуйста, разобраться, что можно понять из результатов Big Y 700 на FTDNA.
Две картинки под текстом - это части одной панели, которя называется Block Tree.
У вас нет необходимых прав для просмотра вложений в этом сообщении.
Кабо - Люцин (Лудза), Латвия; Новозлатополь, Мариуполь, Бердянск; Кручик - Беларусь, Литва, Бердянск; Крючков - Бердянск; Губергриц - Таганрог и Приазовье; Безчинский- Бердянск, Таганрог, Приазовье, Аргентина; Иоголевич - Литва (?), Павлоград, кол. Графская, Пологи, Приазовье, Харбин; Ямпольский - Александровск; Энгель - Бердянск, Орехов, Екатеринослав; Таубер - Львов, Бердянск, Таганрог, Стамбул

Аватара пользователя
MOCKBA
Сообщения: 5974
Зарегистрирован: 23.01.2016
Откуда: Америка
Благодарил (а): 2026 раз
Поблагодарили: 2336 раз

ДНК тесты и генеалогия

#918 MOCKBA » 30 мар 2019, 06:17

Elena G. писал(а):
30 мар 2019, 05:24
Block Tree
У них не такое плохое объяснение.
https://www.familytreedna.com/learn/y-d ... lock-tree/
Похоже на древо, растущее вниз. Каждая ветка от развилки до развилки - это прямоугольник. Внутри прямоугольника перечислены варианты (маркеры), которые отличают эту ветвь от предыдущей (прямоугольника сверху, из которого "вырос" данный прямоугольник). На кончиках веток еще полно "приватных" вариантов, но компания пока не готова разрисовать их в "новые кубики", ждет, когда больше народа протестируется, чтобы понять, какие из "приватных вариантов" всегда идут вместе группой, а какие порознь.
Гоникберг (Могилев-Подольский, Ушицкий уезд, и повсюду), Прусс, Черницкий(Городок Витебской), Пальман (Витебск), Богин, Рудерман (Минск), Лапицкий (Копысь, Киев)

Аватара пользователя
Elena G.
Сообщения: 1881
Зарегистрирован: 04.11.2010
Откуда: Canberra, Australia
Благодарил (а): 591 раз
Поблагодарили: 525 раз
Контактная информация:

ДНК тесты и генеалогия

#919 Elena G. » 30 мар 2019, 06:40

Спасибо, MOCKBA, начинаю понимать. Первый вывод - не все совпаденцы на 111 маркерах - ближайшие родственники, и в то же время могут быть совпаденцы - условно говоря ближайшие родственники, - которые не были показаны на 111 маркерах, но проявились в тесте Big Y 700.
Кабо - Люцин (Лудза), Латвия; Новозлатополь, Мариуполь, Бердянск; Кручик - Беларусь, Литва, Бердянск; Крючков - Бердянск; Губергриц - Таганрог и Приазовье; Безчинский- Бердянск, Таганрог, Приазовье, Аргентина; Иоголевич - Литва (?), Павлоград, кол. Графская, Пологи, Приазовье, Харбин; Ямпольский - Александровск; Энгель - Бердянск, Орехов, Екатеринослав; Таубер - Львов, Бердянск, Таганрог, Стамбул

Аватара пользователя
MOCKBA
Сообщения: 5974
Зарегистрирован: 23.01.2016
Откуда: Америка
Благодарил (а): 2026 раз
Поблагодарили: 2336 раз

ДНК тесты и генеалогия

#920 MOCKBA » 30 мар 2019, 06:47

MOCKBA писал(а):
30 мар 2019, 04:18
как определить, какой из маркеров имеет какое положение на Build 37 и какие аллели, я пока не пойму
пока самый разумный ответ по номенклатуре снипов и их реальным позициям на хромосоме вижу на сайте genetichomeland
https://www.genetichomeland.com/welcome ... snp=Y35934
https://www.genetichomeland.com/welcome ... snp=PF1974
Поскольку ветвь гаплодрева, как правило, определяется сразу несколькими эквивалентными маркерами, и не все анализы смотрят на все маркеры, то зачастую люди в начале считают, что такая-то ветвь пошла от такого-то узла, а другая - из другого узла ... а потом приходит Yfull, проверяет все маркеры на хромосоме, и выясняет, что "родительские узлы" были эквивалентны. Поэтому, видимо, самое авторитетное древо гаплотипов на Yfull, но пока что лучшего описания маркеров с геномной точки зрении - где произошла мутация и что изменилось - я вижу на genetichomeland.
Так что теперь двигаться к концу веточки я собираюсь так - смотреть на Yfull, какие маркеры позволят различить между очередными ветками E1b1b1b2a1b; идти на genetichomeland за соответствующими геномными координатами; и искать в собственном геноме, что там происходит по этим координатам. Если есть вариант проще - дайте знать ))))
Гоникберг (Могилев-Подольский, Ушицкий уезд, и повсюду), Прусс, Черницкий(Городок Витебской), Пальман (Витебск), Богин, Рудерман (Минск), Лапицкий (Копысь, Киев)

Аватара пользователя
Elena G.
Сообщения: 1881
Зарегистрирован: 04.11.2010
Откуда: Canberra, Australia
Благодарил (а): 591 раз
Поблагодарили: 525 раз
Контактная информация:

ДНК тесты и генеалогия

#921 Elena G. » 30 мар 2019, 06:56

А можно ли загрузить результаты Big Y 700 from FTDNA на Yfull? Или там можно сразу выйти на нужную ветвь, получив определяющий снип в Big Y 700? В моем случае это снип R-BY330.
Кабо - Люцин (Лудза), Латвия; Новозлатополь, Мариуполь, Бердянск; Кручик - Беларусь, Литва, Бердянск; Крючков - Бердянск; Губергриц - Таганрог и Приазовье; Безчинский- Бердянск, Таганрог, Приазовье, Аргентина; Иоголевич - Литва (?), Павлоград, кол. Графская, Пологи, Приазовье, Харбин; Ямпольский - Александровск; Энгель - Бердянск, Орехов, Екатеринослав; Таубер - Львов, Бердянск, Таганрог, Стамбул

Ответить

Вернуться в «Генетическая генеалогия»